Durante o processo de replicação bacteriana, a penicilina inibe as enzimas (transpeptidase, carboxipeptidase e endopeptidase), responsáveis pela ligação entre as cadeias peptídicas, impedindo, portanto, o desenvolvimento da estrutura normal do peptidoglicano (ou peptideoglicano).
A penicilina terá um efeito, impedindo que as células bacterianas formem a(o):